Красные дрожжи Phaffia rhodozyma могут применяться в качестве компонента рационов для использования в аквакультуре. Его основная ценность заключается в содержании астаксантина, которого гораздо больше (в 5–50 раз), чем в пище ракообразных. При скармливании радужной форели отложение астаксантина в мясе рыбы зависело от правильной подготовки дрожжевых клеток перед их включением в корм. Астаксантин не был доступен в питательных веществах из интактных дрожжей. Если P. rhodozyma была механически разорвана, ее пигменты перенеслись на мясо радужной форели, окрасив его в лососево-розовый цвет. Наиболее эффективное отложение астаксантина у форели происходило, когда клеточная стенка P. rhodozyma была частично удалена ферментативным расщеплением. Для P. rhodozyma определяли ближайший состав, содержание аминокислот, жирнокислотный профиль и содержание астаксантина. При выращивании в условиях, использованных в данном исследовании, P. rhodozyma имеет низкое содержание белка (~25%) и высокое содержание общих липидов (~17%) по сравнению с большинством других микроорганизмов.

Описаны штаммы Phaffia rhodozyma, которые продуцируют более 3000 м.д. астаксантина в пересчете на сухие дрожжевые вещества при культивировании в объеме питательной среды по меньшей мере примерно 1500 литров и содержат более 4 процентов, предпочтительно более 6 процентов, сухих твердых веществ дрожжей. Эти и другие штаммы культивируются с помощью улучшенного метода ферментации, включающего продление фазы созревания ферментации с помощью одного или нескольких различных методов, включая воздействие на дрожжевые клетки светом низкой интенсивности, медленное снабжение клеток быстро метаболизируемым источником энергии, например, глюкозы и замену быстро метаболизируемого источника энергии медленно метаболизируемым источником энергии, например. глицерин. Клетки этих штаммов включают в корма для животных, особенно в корма для лососевых рыб, для придания или усиления красной пигментации этих животных и продуктов, изготовленных из этих животных.